Primeiro passo para definir esse valor é que você faça um checklist de todas as suas despesas pessoais.
Dessa forma, você saberá mais ou menos quanto é preciso para arcar com suas despesas mensais.
Uma outra forma para você definir seu pró-labore é pensar como empregado e não como empresário.
Imagine o seguinte: se eu trabalhasse em uma outra empresa, exercendo essa mesma atividade que exerço aqui na minha empresa, quanto seria minha remuneração, qual seria o meu salário?
Daí então você pode definir o seu pró-labore.